SUJET : Taxinomie, règles de publication à respecter (idéalement)

TAXI NO MY ! TAXONOMIE !

Euh, je voulais dire taxe à nos mies, tac ! si ! no! mi... Taxi, gnome, hi ! euh taxi- ou taxonomie...

Quel est le nom pédant-savant de l'animal dont j'expose la photographie sur WILIPI ? Comment-donc s'appelle le satané biquet que je photographie ?

Vous l'avez remarqué, WILIPI essaie, pour différentes raisons, toutes aussi bonnes les unes que les autres, voire meilleures, d'employer le nom scientifique des espèces animales photographiées, ou nom binominal, ainsi nommé parce que composé du nom de genre, débutant toujours par une majuscule, et de l'épithète d'espèce, adjectif ou nom débutant toujours par une minuscule.
Cela vaut aussi pour le nom français, majuscule pour le genre, sans exception, et minuscule pour l'espèce, avec bien sûr, des exceptions, soit quand au lieu d'être un adjectif, le nom d'espèce est un nom de famille ou un nom de pays, soit quand l'adjectif qualifiant l'espèce est en premier, comme par exemple le Petit Gravelot. Ce qui nous fait d'ailleurs une double exception. En effet, en français, quand ils ne commencent pas une phrase, les adjectifs ne prennent pas de majuscule, sauf exceptions, dont celle du nom binominal vernaculaire français avec adjectif en premier, ouf ! Mais cela ne vaut que si l'on parle de l'espèce dans son ensemble, si l'on parle d'un individu particulier, on ne met aucune majuscule. Exemple :" J'ai vu un héron cendré dans la mare (un individu, donc). On sait que le Héron cendré aime l'eau" (l'espèce Héron cendré).

Ainsi pour le Milan noir cher à Cécile, ça nous donne genre = Milvus espèce = migrans, éventuellement suivi de l'épithète de sous-espèce, en l'occurence parasiticus (ou peut-être parasitus, qui a dit que c'était simple ?). Et bien sûr, ce nom binominal savant en latin est en italique, quoi de plus normal, et puis il faut bien rester simple, on ne va pas écrire en romain un nom latin, s'pas ?

Pourquoi ?

Eh bien, pour la raison, qui remonte à Linné, au XVIIIe siècle donc, d'être sûr que nous parlons bien de la même chose.

Pour faciliter le référencement des photos.

Pour avoir des galeries par thème et des diaporamas qui vont bien.

Parce que la recherche que cela implique peut permettre d'apprendre des choses intéressantes sur l'objet de nos photographiques attentions.

E tutti quanti.

Des sites pour la taxinomie

Mais d'abord, c'est quoi, la taxinomie ?

C'est délicat, alors je vais laisser la parole à plus précis que moi, plus savant que moi, je dirais même plus sérieux, si c'était possible, c'est dire. Donc, de la bouche de mon ami très cher (mais gratuit sur la Toile) en 16 tomes, Monsieur Téhéleffe lui même, TLF pour les intimes, l'acception exhaustive du mot :

TAXINOMIE, TAXONOMIE, subst. fém.
A. Science des lois et des principes de la classification des organismes vivants; p. ext., science de la classification. Synon. systématique. Taxinomie traditionnelle. Avant le développement de la génétique (...) la classification était livrée à l'arbitraire du systématicien (...) l'étude des chromosomes est aujourd'hui susceptible d'apporter, en certains cas, des indications précieuses à la taxinomie (CUÉNOT, J. ROSTAND, Introd. génét., 1936, p. 73). En biologie, l'étude de la classification a été fort poussée. La classification des organismes vivants a été nommée « taxinomie ». Le but est essentiellement de placer les objets dans des cases reflétant la place qu'ils occupent dans l'arbre de l'évolution (JOLLEY, Trait. inform., 1968, p. 103).
B. Classification d'éléments; suite d'éléments formant des listes qui concernent un domaine, une science. Taxinomie bactériologique, botanique, chimique, zoologique. La taxonomie (...) classe les Animaux et les Plantes en différentes catégories (...). Elle range tous les êtres vivants suivant les caractères qu'ils ont en commun, des plus généraux (règne) aux plus particuliers (espèce) (Biol. t. 2 1970). Ces classes logiques, dont la constitution est étudiée par la taxinomie (anglais taxonomy), se manifestent bien dans le domaine des classifications hiérarchisées et systématiques des sciences naturelles (nomenclatures), mais aussi dans le domaine des hiérarchies d'objets spontanément observés et dénommés à l'intérieur d'une culture (folk taxonomies : taxinomies populaires) (A. REY, La Terminol., 1979, p. 35).
LING. DISTRIBUTIONNELLE. Classification d'éléments, de suites d'éléments formant des listes qui permettront, par leurs règles de combinaison, de rendre compte des phrases d'une langue (d'apr. Ling. 1972).
Rem. L'Académie des Sciences déconseille l'anglicisme taxonomie qui est cependant la forme la plus fréq. utilisée par les biologistes. En ling., seule la forme taxinomie est employée.
REM. Taxinomiste, taxonomiste, subst. Spécialiste en taxinomie. La botanique de terrain (...) a donné naissance à une autre discipline (...) qui attire à elle les meilleurs des taxonomistes, la biosystématique (Hist. gén. sc., t. 3, vol. 2, 1964, p. 772).
Prononc.: [], . Étymol. et Hist. a)1813 taxonomie « théorie des classifications appliquée au règne végétal » (DE CANDOLLE, Théorie Élém. de la bot., p. 19); b) 1868 taxinomie « id. » (DUPINEY DE VOREPIERRE, Dict. fr. illustré et encyclop. univ., s.v. taxonomie: Taxonomie et mieux taxinomie). Formé de tax(i, o)-* et de -nomie*. Les formes taxonomie, taxonomique correspondent à l'angl. taxonomy (1828 ds Webster's), taxonomic (1852 ds NED). Pour la discussion autour de la formation de taxinomie et de taxonomie, v. en partic. les articles de J.-L. FISCHER et R. REY, De l'origine et de l'usage de taxinomie-taxonomie ds Doc. Hist. Voc. sc., 1983 no 5, pp. 97-113 et de M. TRAVERS, Sur quelques questions de terminologie sc. ds Banque mots, 1981 no 21, pp. 7-11).
DÉR. Taxinomique, taxonomique, adj. Qui se rapporte à la taxinomie, aux lois de la classification; qui repose sur des classifications. Groupe, série, unité, variable taxinomique; analyse, conception, démarche, modèle, procédure taxinomique. La disposition des glandes vitellogènes est un caractère taxonomique (Zool., t. 1, 1963, p. 595 [Encyclop. de la Pléiade]). Le saussurisme a été « complété » (voire contesté) par une nouvelle linguistique, principalement représentée par Chomsky (...), linguistique moins taxinomique, car elle ne vise plus tant au classement et à l'analyse des signes qu'aux règles de production de la parole (R. BARTHES ds Les Lettres fr., 2 mars 1967, p. 12, col. 2). L'empl. de l'anglicisme taxonomique est déconseillé par l'Académie des Sciences; en ling. l'adj. taxinomique prévaut. [], . 1res attest. a) 1832 taxonomique (RAYMOND), 1836 taxonomique (A. COMTE, Philos. posit., 42e leçon, p. 427 ds Doc. Hist. Vocab. sc. 1983 no 5, p. 105), b) 1872 taxinomique (LITTRÉ); de taxo(taxi)nomie, suff. -ique*.

Bon, ça, c'est de la définition, s'pas ?
D'accord, mais nous, nous ne sommes pas des savants, alors comment faisons-nous pour le savoir, le nom savant de la bestiole ou du biquet ou du piafou ?

Déjà, on se renseigne sur son nom vernaculaire. Vernaculaire, c'est le nom que l'on emploie dans la langue du pays. Même que le plus souvent, il y en a plusieurs de noms vernaculaires, mais un seul nom binominal est reconnu... Chardonneret élégant, Autruche d'Afrique, au hasard...

Si c'est en anglais, et c'est souvent en anglais, Afrique de l'Est, de l'Ouest, du Sud, Australie, Asie du Sud-Est, Indes, Amérique, même du Sud, ils ont été partout nos amis anglo-saxons, eh bien, il faut chercher sur Google qui est notre ami, ou dans des bouquins spécialisés, les guides ornitho sérieux ont souvent un index multilingue.
Ensuite, il faut chercher dans les sites spécialisés que l'on a trouvés. L'Internet offre plusieurs solutions déjà ponctuellement citées, mais que je regroupe ci-dessous (vos adresses et suggestions sont, comme toujours, les très bienvenues).

Des sites pour l'identification

Il ne sert à rien de connaître le nom scientifique binominal en latin (et en italique) si l'on n'est pas sûr et certain de l'espèce photographiée. Il existe heureusement des sites pour aider à s'en assurer.

MAMMIFÈRES

Alors, tout d'abord, pour nos amis Mammifères (environ 6500 espèces), deux sites (en anglais) :

la liste rouge des espèces menacées de l'IUCN (IUCN Red List of Threatened Species)

le site de l'American Society of Mammologists

OISEAUX

Pour les Oiseaux (environ 10 000 espèces)], les sites francophones de référence sont oiseaux.net , agrémenté de nombreuses bonnes (et quelques moins bonnes) photographies, et Avibase , moins bien illustré.

En anglais, on dispose du :

Cornell Lab of Ornithology's

Et Zoonomen , avec 10 701 espèces référencées, un site jusqu'à present régulièrement tenu à jour

Site officiel pour TOUS LES ANIMAUX :

ZOOBANK

ZooBank est un site web en libre accès destiné à devenir qui est le registre officiel de la Commission internationale de nomenclature zoologique (ICZN)3. Tout acte de nomenclature (par exemple, les publications qui créent ou modifient un nom taxinomique) doit être enregistré auprès de ZooBank pour être reconnu officiellement par le Code international de nomenclature zoologique. Source : Wikipedia

POUR LE RESTE

Pour les Reptiles, Batraciens, Poissons, Insectes, Arachnides, Mollusques, Éponges, Échinodermes, Virus, Bactéries, et j'en passe, et même pour les plantes, les champignons, les algues, les protozoaires, on se référera au

Système d'Information Taxonomique Intégré

ou, en l'occurence, à son site canadien, qui vaut aussi, si l'on veut, pour Mammifères et Oiseaux. Attention, l'ergonomie n'est pas le point fort du site.

Enfin, last but not least,il ne faut pas négliger les talents et la gentillesse des copains, notamment dans la rubrique Identification de WILIPI !

On récapitule :


Nom binominal :

Le nom d'une espèce est binominal, car composé d"un nom de Genre, commençant sans exception par une majuscule, et d'une épithète caractérisant l'espèce, commençant par une minuscule (sauf exceptions en langue vernaculaire). D'après le Code international de nomenclature zoologique , c'est un "binom" composé donc d'un "nom générique "et d'une "épithète spécifique". Cette épithète peut être un adjectif (au hasard l'"élégant" de Chardonneret élégant) ou un substantif, en apposition (au hasard, le "camelus" de Struthio camelus) ou en complément de nom, comme le "de Jackson/jacksoni" de Calao de Jackson/Tockus jacksoni

Nom scientifique

Ce binom est toujours écrit en italique et il est "latinisé". Parfois, souvent, du latin de cuisine, mélange d'un mot grec latinisé et de latin. Et le binom ne se décline pas, mais l'épithète spécifique s'accorde avec le nom de genre en genre (... ! Vannellus senegallus et Upupa africana ) ou se met au génitif (Tockus jaksoni). Il est écrit avec toujours les mêmes règles de majuscule au début du nom générique et de minuscule au début de l'épithète spécifique, et le genre est toujours en premier, contrairement aux noms vernaculaires anglais, où il est le dernier, et à certains noms vernaculaires français (Grand Ibijau). Le nom d'espèce commence toujours par une minuscule, il n'y a pas d'exception, les noms de famille et de pays sont "adjectives" comme dans Tockus jacksoni, Calao de Jackson, Upupa africana, Huppe d'Afrique.

Nom vernaculaire français "savant" :

Il est également binominal, nom de Genre + nom d'espèce.
Genre avec une majuscule : Chardonneret élégant, Autruche d'Afrique,
Espèce avec une minuscule : Chardonneret élégant[/b] sauf les exceptions de pays, de nom de famille, Autruche d'Afrique, Calao de Jackson ou de position de l'épithète spécifique en premier Petit Gravelot.

Travaux pratiques

"Tiens est ce donc un chardonneret ou une autruche en vol que j'ai photographiés ?" Pas de majuscule ici car il s'agit d'individu (ou de groupes d'individus). Le Chardonneret élégant, Carduelis carduelis, vole mieux que l'Autruche d'Afrique, Struthio camelus, généralement. Donc, j'ai photographié un chardonneret et non une autruche.
Et ce, même si j'emploie le nom vernaculaire français "savant", binominal, surtout quand il y a risque de confusion, "J'ai vu un guêpier nain égaré au milieu des guêpiers écarlates" Si j'évoque les particularités de l'espèce, hop ! je remajuscule : "le Guêpier nain est un plus petit guêpier par la taille que le Guêpier écarlate, mais aussi grand par l'appétit", etc.

Pour les Oiseaux, les noms vernaculaires français sont décidés par la "Commission internationale des noms français des oiseaux" (CINFO) créée par le Comité ornithologique international en décembre 1990. La CINFO est sous une présidence belgo-canadienne, ce qui explique des choix parfois surprenants, ainsi le Bruant des neiges, Plectrophenax nivalis, qui serait (?) devenu le Plectrophane des neiges et le Perroquet de nuit qui a été rebaptisé en français (sic) Strigops kakapo. Une base de donnée est disponible , mais elle est basée sur une publication de 1993 et ne connaît donc pas la valse des taxons introduite par la cladistique (classification "phylogénétique", basée sur la génétique) qui a chamboulé les genres.

edit/Catherine : pour des raisons de commodité et de cohérence, sur wilipi, nous prenons les noms français sur oiseaux.net .
Le site est mis à jour tous les ans avec la liste de l'IOC (le Comité ornithologique international, à l'envers en étranger). Les taxons sont, eux aussi, à jour, ce sont les mêmes que sur avibase .

C'est noté

Quel boulot ! Je viens de tout lire, c'est toujours utile
J'ai fait un petit edit au sujet des noms de piafous. Prenez les sur oiseaux.net ça permet que nous soyons cohérents. Ce site est à jour pour les nouveaux taxons. Ça évite de voir encore des Larus ridibundus par exemple... Attention, certains très bon sites comme le HBWalive sont en retard pour la mise à jour des taxons.
Pour ceux que ça intéresse, avibase a un outil de comparaison des taxons qui peut être utile.
Voilou

Je savais qu'il y avait des règles... Je pensais pas autant... Bon, je vais m'y référer souvent, mais je crois que je vais encore me tromper un peu le temps que j'apprivoise la chose...
Gros boulot. Merci

Souvent, Seb, c'est le bon chemin !
Car en respectant souvent souvent, on finit par suivre les règles presque tout le temps quand ça en vaut la peine, même si ce n'est pas toujours toujours (ainsi moi, par exemple, au hasard pour Struthio camelus ou pour Carduelis carduelis, il m'arrive d'en oublier les majuscules à l'oral).

gros boulot, merci !!!

J'ai profité de la discussion dans l'excellent carnet de voyage de Jean-Christophe sur le changement du nom du Chacal à chabraque qui est passé du genre Canis au genre Lupulella (eh oui, l'Homo sapiens n'est pas le seul à jouer les transgenres) pour mettre à jour les liens de 2016 qui étaient obsolètes, notamment ceux pour les Mammifères.

J'ai aussi rajouté ZOOBANK, qui est le registre officiel de la Commission internationale de nomenclature zoologique - en anglais, International Commission on Zoological Nomenclature — ICZN), qui en est d'ailleurs resté à Canis mesomelas.